UNIDAD DE GENÓMICA Y BIOINFORMÁTICA

La Unidad de Genómica y Bioinformática proporciona asesoramiento en el diseño y planificación de estudios, así como en la exploración de datos de secuenciación masiva. Nuestra misión es generar datos genómicos y ayudar al usuario a extraer toda la información relevante de los datos de secuenciación y orientar a la adecuada interpretación de los resultados.

EQUIPAMIENTO DE LA UNIDAD

Equipamiento Genómica y Bioinformática

  • qPCR StepOnePlus, Applied Biosystems,USA
  • Secuenciador NGS MiSeq-Illumina, USA
  • Secuenciador 3500 Genetic Analyzer,Applied Biosystems, USA
  • Electroforesis Capilar FragmentAnalyzer, Advanced Analytical, USA.

 APLICACIONES Y SERVICIOS DE LA UNIDAD

Secuenciación y Bioinformática

  • Cuantificación de DNA, RNA y proteínas en microvolúmenes

  • Evaluación de la expresión génica bajo diferentes condiciones

  • Secuenciación Sanger y de Microsatélites y Campo Claro

  • Secuenciación multilocus (MLSA, MLST)

  • Control de calidad de bibliotecas genómicas

  • Secuenciación de genomas pequeños (plásmidos, virus, bacterias y hongos)

  • Secuenciación de genes marcadores (16S, 18S, ITS, COI, etc)

  • RNAseq y secuenciación de microRNAs

  • Secuenciación de metagenomas: diversidad microbiana (16S, 18S, ITS)

  • Secuenciación de miRNAs, siRNA y otros pequeños RNAs

  • Paneles de genes prediseñados

  • Entrenamientos y cursos de capacitación

    Otros (consultar al encargado)

  • Control de calidad y procesamiento de datos crudos (reads generados por los secuenciadores)

  • Ensamblaje y mapeamiento de genomas

  • Anotación genómica

  • Anotación taxonómica basada en genes marcadores (16S, 18S, ITS, COI, etc)

  • Caracterización genómica

  • Genómica comparativa y análisis de pangenoma

  • Análisis evolutivos y filogeográficos de patógenos

  • Análisis de diversidad microbiana y metagenómica

  • Análisis de RNA-seq

  • Taxonomía genómica y Filogenómica

  • Distribución de Linux para bioinformática UniGenBio

  • Entrenamientos y cursos de capacitación

    Otros (consultar al encargado)

Para acceder al análisis bibliográfico, protocolos, uso de equipamiento y servicios debe completar el ficha de solicitud descargable e indicar su requerimiento. Debe ser enviada vía mail al encargado de unidad (cc bioren@ufrontera.cl) los días jueves y hasta el el viernes de cada semana. El horario asignado será informado vía mail el viernes durante la tarde.

 NUESTRO EQUIPO 

Dr. Michel Abanto

Dr. Michel Abanto

Encargado de la Unidad

Encargado de Unidad Genómica y Bioinformática