UNIDAD DE GENÓMICA

Unidad de Genómica

Equipos
– qPCR StepOnePlus, Applied Biosystems,USA
– Secuenciador NGS MiSeq-Illumina, USA
– Secuenciador 3500 Genetic Analyzer,Applied Biosystems, USA
– Electroforesis Capilar FragmentAnalyzer, Advanced Analytical, USA.


Aplicaciones

  • Cuantificación de DNA, RNA y proteínas en microvolúmenes (placa Take3).
  • Compararción cuantitativa de la expresión de proteínas de dos muestras.
  • Cambios en la expresión génica bajo la influencia de factores ambientales.
  • Obtención de fracciones puras de compuestos activos (área farmacéutica, bioquímica, química, ambiental, alimentaria, entre otros).

Aplicaciones Secuenciación

  • Secuenciación de genomas pequeños.
  • Secuenciación de novo. Re-secuenciación.
  • Plásmidos. Re-cuenciación dirigida: Secuenciación de amplicones (centenas de blancos).
  • Captura de regiones de interés Metagenómica del 16S Chequeo de Clones.
  • Secuenciación de paneles prediseñados.
  • Control de calidad de bibliotecas genómicas: Control de Calidad para secuenciación en HiSeq Regulación: ChiP – Seq.
  • Otra: Genotipificación por secuenciación (reducción de complejidad de genomas de mayor tamaño).

Tm. Claudio Vásquez claudio.vasquez@ufrontera.cl 

Dr. Michel Abanto – Análisis Bioinformático – michel.abanto@ufrontera.cl

BIOREN – Universidad de La Frontera

UNIDAD DE GENÓMICA, PROTÓMICA Y METABOLÓMICA

Unidad de Genómica

Equipos
– qPCR StepOnePlus, Applied Biosystems,USA
– Secuenciador NGS MiSeq-Illumina, USA
– Secuenciador 3500 Genetic Analyzer,Applied Biosystems, USA
– Electroforesis Capilar FragmentAnalyzer, Advanced Analytical, USA.

Unidad de Proteómica y Metabolómica

Equipos
– HPLC Semipreparativo, Shimadzu Prominence LC-20AT, JP
– HPLC Shimadzu LC-20 AD acoplado a espectrómetro (MSMSQ) API 3200 Qtrap, Applied Biosystems, USA
– MALDI-TOF MS/MS Autoflex Speed,Bruker-Alemania
– Ultracentrífuga XPN-100 Beckman Coulter, USA


Aplicaciones

  • Cuantificación de DNA, RNA y proteínas en microvolúmenes (placa Take3).
  • Compararción cuantitativa de la expresión de proteínas de dos muestras.
  • Cambios en la expresión génica bajo la influencia de factores ambientales.
  • Obtención de fracciones puras de compuestos activos (área farmacéutica, bioquímica, química, ambiental, alimentaria, entre otros).

Aplicaciones Secuenciación

  • Secuenciación de genomas pequeños.
  • Secuenciación de novo. Re-secuenciación.
  • Plásmidos. Re-cuenciación dirigida: Secuenciación de amplicones (centenas de blancos).
  • Captura de regiones de interés Metagenómica del 16S Chequeo de Clones.
  • Secuenciación de paneles prediseñados.
  • Control de calidad de bibliotecas genómicas: Control de Calidad para secuenciación en HiSeq Regulación: ChiP – Seq.
  • Otra: Genotipificación por secuenciación (reducción de complejidad de genomas de mayor tamaño).
  • Análisis alimentario (pesticidas, toxinas, hormonas, alérgenos, antibióticos, esteroides, entre otros).
  • Análisis de biomoléculas (péptidos, proteínas, aminoácidos).
  • Análisis de metabollitos secundarios de plantas (antioxidantes, alcaloides, carotenoides, terpenos, entre otros).

Aplicaciones Maldi TOF

  • Tecnologías proteómicas ultra-sensibles.
  • descubrimientos de medicamento.
  • Análisis de moléculas orgánicas pequeñas y grandes.
  • Análisis de oligosacáridos, fosfopéptidos, lípidos, ADN, ARN, PNA, azúcares, polímeros sintéticos, dendrímeros y otras macromoléculas.
  • Perfilado MALDI-TOF para identificación microbiana.
  • Imágenes de tejidos.

Encargados

Dra. Nathalia Días nathalia.dias@ufrontera.cl 

Tm. Claudio Vásquez claudio.vasquez@ufrontera.cl 

Qa. Jennifer Cartes jennifer.cartes@ufrontera.cl 

BIOREN – Universidad de La Frontera