Cultivo microbiano observado en una placa de Petri

UNIDAD DE MICROBIOLOGÍA Y MICROBIOMA

Microbiología, Microbiomas y Biorecursos

Investigadora trabajando con cultivos microbiológicos en BIOREN-UFRO

La Unidad de Microbiología y Microbioma de BIOREN-UFRO integra capacidades en microbiología, ecología microbiana, análisis de microbiomas y gestión de biorecursos para estudiar, conservar, caracterizar y valorizar la diversidad microbiana asociada a sistemas naturales, agrícolas, ambientales, alimentarios y de salud.

Nuestra aproximación conecta el estudio de microorganismos individuales con comunidades microbianas complejas, integrando herramientas microbiológicas tradicionales y avanzadas con genómica, bioinformática y caracterización funcional. Esta estrategia permite avanzar desde la identificación y descripción de la diversidad microbiana hacia la comprensión de sus funciones, su aislamiento y validación experimental y, finalmente, su potencial utilización en investigación, innovación y desarrollo tecnológico.

La Unidad alberga la Colección Chilena de Cultivos Tipo (CCCT), plataforma de conservación y gestión de recursos microbianos de BIOREN-UFRO, que mantiene bacterias, levaduras y hongos filamentosos, incluyendo microorganismos provenientes de diversos biomas y ecosistemas de Chile. La CCCT constituye el núcleo de biorecursos de la Unidad y permite conectar la preservación de microorganismos con su caracterización fenotípica, funcional y genómica y con potenciales aplicaciones biotecnológicas.

MICROBIOLOGÍA Y CARACTERIZACIÓN FUNCIONAL

Estudiamos microorganismos mediante aproximaciones cultivables y experimentales, desde su aislamiento y purificación hasta su caracterización fenotípica y funcional.

La Unidad tiene capacidades a convenir para busca generar información que permita no solo establecer qué microorganismo está presente, sino también comprender qué características posee, qué funciones puede desempeñar y cómo interactúa con su ambiente.

Capacidades y servicios a convenir

  • Aislamiento y purificación de bacterias, hongos y levaduras.
  • Tinción de Gram y otras tinciones a convenir
  • Recuperación de microorganismos desde cultivos mixtos y muestras complejas.
  • Cultivo y mantenimiento de microorganismos.
  • Caracterización morfológica, fisiológica y bioquímica.
  • Evaluación de viabilidad y pureza de cultivos.
  • Ensayos de interacción microorganismo–microorganismo.
  • Evaluación de características funcionales de microorganismos de interés.
  • Screening y selección de cepas con potencial biotecnológico.
  • Desarrollo de ensayos microbiológicos personalizados según requerimientos de investigación o I+D.

MICROBIOMAS Y ECOLOGÍA MICROBIANA

Abordamos el microbioma como una comunidad dinámica de microorganismos que interactúa con su hospedero y con las condiciones ambientales.

La Unidad apoya estudios de microbiomas asociados a suelos, plantas, ambientes naturales, sistemas productivos, alimentos, animales y salud, integrando información molecular con aislamiento microbiológico, experimentación y caracterización funcional.

Los estudios de secuenciación, metabarcoding, metagenómica y análisis bioinformático se desarrollan en articulación con la Unidad de Genómica y Bioinformática de BIOREN-UFRO, permitiendo construir flujos integrados desde la muestra y el microorganismo hasta el análisis de comunidades y su interpretación biológica. La Unidad de Genómica actualmente dispone de servicios de genes marcadores, genomas microbianos, metagenómica y análisis de diversidad microbiana.

Capacidades

  • Diseño experimental de estudios de microbiomas.
  • Procesamiento microbiológico de muestras ambientales y biológicas.
  • Análisis y conteos de la fracción cultivable de comunidades microbianas.
  • Aislamiento dirigido de microorganismos a convenir de interés a partir de estudios de microbioma.
  • Integración de información de microbiomas con características ambientales, fenotípicas y funcionales.
  • Estudio de interacciones entre microorganismos, hospedero y ambiente.
  • Desarrollo y evaluación experimental de comunidades microbianas y consorcios.

BIORECURSOS MICROBIANOS – CCCT

La Colección Chilena de Cultivos Tipo (CCCT) constituye el núcleo de conservación y gestión de recursos microbiológicos de la Unidad.

Su objetivo es preservar microorganismos y su información asociada, asegurando su disponibilidad para investigación, formación, innovación y aplicaciones productivas, bajo procedimientos de conservación, trazabilidad y gestión de calidad.

La CCCT preserva actualmente microorganismos procedentes de distintos biomas chilenos, incluyendo Los Andes, Desierto de Atacama, Territorio Antártico Chileno, Rapa Nui y ecosistemas costeros y del Océano Pacífico, utilizando criopreservación y liofilización.

Servicios de la CCCT

  • Depósito público de microorganismos.
  • Depósito restringido y conservación confidencial.
  • Depósito público de microorganismos + genoma (en conjunto con la Unidad de Genómica y Bioinformática)
  • Criopreservación a –80 °C.
  • Liofilización de microorganismos.
  • Conservación y mantenimiento de cepas.
  • Distribución de cepas de colección y cepas tipo.
  • Distribución de microorganismos en cultivo fresco o liofilizado.
  • Aislamiento y purificación de microorganismos.
  • Recuperación y reactivación de cultivos.
  • Gestión de información asociada a los recursos microbiológicos.